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Long-form thoughts on bioinformatics, genomics, data science, and scientific research.

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Cuando Borges se adelantó a los gemelos digitales

Cuando Borges se adelantó a los gemelos digitales

18 de septiembre de 2026

Este verano estuve trabajando en una presentación sobre gemelos digitales en salud usando datos multiómicos. La idea, en pocas palabras: construir un modelo computacional de un paciente —integrando genómica, proteómica, metabolómica y más— capaz de simular su evolución clínica, anticipar riesgos y probar tratamientos antes de aplicarlos en la vida real. Mientras investigaba, me topé […]

Artificial Intelligence Is Not Artificial Wisdom

Artificial Intelligence Is Not Artificial Wisdom

18 de septiembre de 2026

That was the best summary of our last meeting recording the podcast “Artificial Intelligence Is Not Artificial Wisdom.” Marjorie Mccubbins Muhammad Izhar Ul Haq and I talked about “𝐫𝐞𝐭𝐡𝐢𝐧𝐤𝐢𝐧𝐠 𝐛𝐢𝐨𝐢𝐧𝐟𝐨𝐫𝐦𝐚𝐭𝐢𝐜𝐬 𝐞𝐱𝐩𝐞𝐫𝐭𝐢𝐬𝐞 𝐢𝐧 𝐭𝐡𝐞 𝐞𝐫𝐚 𝐨𝐟 𝐚𝐫𝐭𝐢𝐟𝐢𝐜𝐢𝐚𝐥 𝐢𝐧𝐭𝐞𝐥𝐥𝐢𝐠𝐞𝐧𝐜𝐞” (inspired by a hugely popular article published this year) Thanks Genyxlcc for this gift There couldn’t have been […]

RNA-Seq: From FASTQ to Counts

RNA-Seq: From FASTQ to Counts

4 de mayo de 2026

As a bioinformatician, the most common request I receive is to analyze sequencing data.  I prepared this seminar focused on the recommendations I would love to have when I’ve started on this path. Whether you’re working with private or public data, here’s the workflow I always recommend: ✅ Set up a clean project folder from […]

 𝐅𝐀𝐈𝐑 𝐝𝐚𝐭𝐚 𝐦𝐚𝐧𝐚𝐠𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐚𝐧𝐝 𝐀𝐠𝐢𝐥𝐞 𝐩𝐫𝐚𝐜𝐭𝐢𝐜𝐞𝐬

 𝐅𝐀𝐈𝐑 𝐝𝐚𝐭𝐚 𝐦𝐚𝐧𝐚𝐠𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐚𝐧𝐝 𝐀𝐠𝐢𝐥𝐞 𝐩𝐫𝐚𝐜𝐭𝐢𝐜𝐞𝐬

4 de mayo de 2026

As a bioinformatician, I’ve seen firsthand how integrating Open Science principles 𝒆𝒔𝒑𝒆𝒄𝒊𝒂𝒍𝒍𝒚 𝑭𝑨𝑰𝑹 𝒅𝒂𝒕𝒂 𝒑𝒓𝒂𝒄𝒕𝒊𝒄𝒆𝒔 can significantly boost quality and productivity in research projects. It’s true that at the beginning there is a significant initial investment of time and effort. But when you reach 𝐩𝐮𝐛𝐥𝐢𝐜𝐚𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐭𝐢𝐦𝐞 and resources, energy, and budget become limited—that early investment […]

Introduction to Bioinformatics for Genomics

Introduction to Bioinformatics for Genomics

4 de mayo de 2026

𝐀𝐫𝐞 𝐰𝐞 𝐟𝐚𝐜𝐢𝐧𝐠 𝐚 5𝐭𝐡 𝐧𝐚𝐫𝐜𝐢𝐬𝐬𝐢𝐬𝐭𝐢𝐜 𝐰𝐨𝐮𝐧𝐝 𝐰𝐢𝐭𝐡 𝐭𝐡𝐞 𝐫𝐢𝐬𝐞 𝐨𝐟 𝐠𝐞𝐧𝐞𝐫𝐚𝐭𝐢𝐯𝐞 𝐀𝐈? I couldn’t resist bringing this question into my first seminar on the instats platform, where I introduced key bioinformatics methods for analyzing sequencing and genomics data, celebrating 25 years since the first publication of the human genome sequence. instats is a mission-driven […]

Sociólogos al rescate

22 de abril de 2026

Cómo se elaboran encuestas para evitar los sesgos en la colección de datos demográficos? 📻 Nuevo episodio de Activismo de Datos en femiñetas Radio con Florencia Coll  En esta nueva edición de Activismo de datos, hablamos entre otras cosas del concepto de  la importancia de  desagregar en el análisis de datos sociológicos ¿Con esto suficiente […]